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187. 重复的DNA序列

DNA序列 由一系列核苷酸组成,缩写为 A, C, GT.。

  • 例如,ACGAATTCCG 是一个 DNA序列

在研究 DNA 时,识别 DNA 中的重复序列非常有用。

给定一个表示 DNA序列 的字符串 s ,返回所有在 DNA 分子中出现不止一次的 长度为 10 的序列(子字符串)。你可以按 任意顺序 返回答案。

示例 1:

输入:s = "AAAAACCCCCAAAAACCCCCCAAAAAGGGTTT"
输出:["AAAAACCCCC","CCCCCAAAAA"]

示例 2:

输入:s = "AAAAAAAAAAAAA"
输出:["AAAAAAAAAA"]

提示:

  • 0 <= s.length <= 105

  • s[i] == A、C、G or T

思路分析

最容易想到的方式就是暴力法,从当前位置出发,与从下一个位置出发,逐个比较十个字符,如果都相等,则符合要求。通过 30/31 个测试用例。

看题解,竟然可以直接子串+哈希,优化一下,直接使用 Set 集合来判重。

  • 一刷

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/**
 * 使用集合优化
 * <p>
 * 优化前:暴力法,通过 30/31 个测试用例。
 *
 * @author D瓜哥 · https://www.diguage.com
 * @since 2025-06-29 23:01:27
 */
public List<String> findRepeatedDnaSequences(String s) {
  Set<String> dict = new HashSet<>();
  Set<String> result = new HashSet<>();
  for (int i = 0; i <= s.length() - 10; i++) {
    String sub = s.substring(i, i + 10);
    if (dict.contains(sub)) {
      result.add(sub);
    } else {
      dict.add(sub);
    }
  }
  return new ArrayList<>(result);
}